Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CDO1Q16878 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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