Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDO1Q16878 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDO1Q16878 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CDO1Q16878 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDO1Q16878 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDO1Q16878 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDO1Q16878 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDO1Q16878 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDO1Q16878 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDO1Q16878 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDO1Q16878 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDO1Q16878 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDO1Q16878 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDO1Q16878 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDO1Q16878 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDO1Q16878 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDO1Q16878 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CDO1Q16878 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDO1Q16878 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDO1Q16878 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDO1Q16878 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDO1Q16878 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDO1Q16878 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDO1Q16878 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDO1Q16878 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDO1Q16878 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDO1Q16878 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDO1Q16878 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDO1Q16878 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDO1Q16878 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDO1Q16878 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDO1Q16878 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CDO1Q16878 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDO1Q16878 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDO1Q16878 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDO1Q16878 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDO1Q16878 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDO1Q16878 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDO1Q16878 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDO1Q16878 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDO1Q16878 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDO1Q16878 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDO1Q16878 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDO1Q16878 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDO1Q16878 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDO1Q16878 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDO1Q16878 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDO1Q16878 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDO1Q16878 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDO1Q16878 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDO1Q16878 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDO1Q16878 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDO1Q16878 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDO1Q16878 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDO1Q16878 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDO1Q16878 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDO1Q16878 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDO1Q16878 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDO1Q16878 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDO1Q16878 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CDO1Q16878 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDO1Q16878 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDO1Q16878 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDO1Q16878 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDO1Q16878 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDO1Q16878 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDO1Q16878 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDO1Q16878 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDO1Q16878 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDO1Q16878 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDO1Q16878 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDO1Q16878 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDO1Q16878 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDO1Q16878 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDO1Q16878 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDO1Q16878 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDO1Q16878 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDO1Q16878 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDO1Q16878 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDO1Q16878 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDO1Q16878 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDO1Q16878 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDO1Q16878 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDO1Q16878 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDO1Q16878 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDO1Q16878 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDO1Q16878 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CDO1Q16878 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDO1Q16878 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDO1Q16878 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDO1Q16878 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDO1Q16878 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDO1Q16878 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDO1Q16878 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CDO1Q16878 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDO1Q16878 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDO1Q16878 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDO1Q16878 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDO1Q16878 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDO1Q16878 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
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