Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF40O75150 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RNF40O75150 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RNF40O75150 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF40O75150 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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