Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF183Q96D59 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms