Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRIP10Q15642 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms