Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTCH1Q13635 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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