Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2FP61218 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms