Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CARD11Q9BXL7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CARD11Q9BXL7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms