Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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