Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC15Q9P013 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC15Q9P013 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms