Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP44Q9C0F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP44Q9C0F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms