Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE12Q6L8Q7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE12Q6L8Q7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms