Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms