Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGCXP38435 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGCXP38435 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGCXP38435 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGCXP38435 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGCXP38435 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGCXP38435 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGCXP38435 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGCXP38435 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGCXP38435 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGCXP38435 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGCXP38435 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGCXP38435 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGCXP38435 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGCXP38435 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGCXP38435 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGCXP38435 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGCXP38435 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGCXP38435 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGCXP38435 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms