Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGDSO95455 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGDSO95455 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGDSO95455 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGDSO95455 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGDSO95455 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGDSO95455 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGDSO95455 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGDSO95455 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGDSO95455 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGDSO95455 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGDSO95455 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGDSO95455 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGDSO95455 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGDSO95455 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGDSO95455 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms