Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TGDSO95455 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TGDSO95455 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TGDSO95455 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TGDSO95455 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TGDSO95455 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TGDSO95455 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TGDSO95455 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TGDSO95455 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TGDSO95455 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TGDSO95455 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TGDSO95455 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TGDSO95455 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TGDSO95455 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TGDSO95455 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TGDSO95455 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TGDSO95455 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TGDSO95455 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TGDSO95455 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TGDSO95455 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TGDSO95455 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TGDSO95455 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TGDSO95455 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TGDSO95455 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TGDSO95455 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TGDSO95455 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TGDSO95455 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TGDSO95455 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TGDSO95455 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TGDSO95455 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TGDSO95455 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TGDSO95455 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TGDSO95455 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TGDSO95455 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TGDSO95455 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TGDSO95455 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TGDSO95455 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TGDSO95455 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TGDSO95455 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TGDSO95455 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TGDSO95455 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TGDSO95455 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TGDSO95455 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TGDSO95455 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TGDSO95455 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGDSO95455 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGDSO95455 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGDSO95455 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGDSO95455 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGDSO95455 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGDSO95455 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGDSO95455 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGDSO95455 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TGDSO95455 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TGDSO95455 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGDSO95455 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGDSO95455 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGDSO95455 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGDSO95455 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGDSO95455 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGDSO95455 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGDSO95455 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TGDSO95455 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGDSO95455 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGDSO95455 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGDSO95455 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGDSO95455 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TGDSO95455 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TGDSO95455 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGDSO95455 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGDSO95455 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGDSO95455 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TGDSO95455 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGDSO95455 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGDSO95455 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TGDSO95455 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TGDSO95455 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TGDSO95455 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TGDSO95455 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TGDSO95455 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGDSO95455 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGDSO95455 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGDSO95455 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGDSO95455 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGDSO95455 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGDSO95455 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGDSO95455 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGDSO95455 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGDSO95455 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGDSO95455 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGDSO95455 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGDSO95455 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGDSO95455 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGDSO95455 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGDSO95455 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TGDSO95455 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGDSO95455 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGDSO95455 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGDSO95455 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGDSO95455 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms