Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms