Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
CD164Q04900 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CD164Q04900 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CD164Q04900 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms