Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms