Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms