Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms