Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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