Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
LNX2Q8N448 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LNX2Q8N448 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LNX2Q8N448 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LNX2Q8N448 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LNX2Q8N448 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LNX2Q8N448 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LNX2Q8N448 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LNX2Q8N448 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LNX2Q8N448 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LNX2Q8N448 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LNX2Q8N448 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LNX2Q8N448 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LNX2Q8N448 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LNX2Q8N448 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNX2Q8N448 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNX2Q8N448 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNX2Q8N448 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNX2Q8N448 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LNX2Q8N448 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNX2Q8N448 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNX2Q8N448 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LNX2Q8N448 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LNX2Q8N448 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LNX2Q8N448 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LNX2Q8N448 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNX2Q8N448 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNX2Q8N448 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LNX2Q8N448 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LNX2Q8N448 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LNX2Q8N448 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LNX2Q8N448 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNX2Q8N448 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LNX2Q8N448 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LNX2Q8N448 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LNX2Q8N448 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LNX2Q8N448 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNX2Q8N448 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LNX2Q8N448 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNX2Q8N448 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNX2Q8N448 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNX2Q8N448 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LNX2Q8N448 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LNX2Q8N448 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LNX2Q8N448 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNX2Q8N448 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNX2Q8N448 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNX2Q8N448 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNX2Q8N448 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNX2Q8N448 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNX2Q8N448 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LNX2Q8N448 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNX2Q8N448 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNX2Q8N448 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNX2Q8N448 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LNX2Q8N448 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNX2Q8N448 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNX2Q8N448 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNX2Q8N448 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNX2Q8N448 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNX2Q8N448 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNX2Q8N448 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNX2Q8N448 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LNX2Q8N448 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNX2Q8N448 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNX2Q8N448 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNX2Q8N448 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNX2Q8N448 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNX2Q8N448 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNX2Q8N448 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNX2Q8N448 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LNX2Q8N448 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LNX2Q8N448 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LNX2Q8N448 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LNX2Q8N448 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNX2Q8N448 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNX2Q8N448 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNX2Q8N448 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNX2Q8N448 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNX2Q8N448 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LNX2Q8N448 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNX2Q8N448 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LNX2Q8N448 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LNX2Q8N448 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LNX2Q8N448 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNX2Q8N448 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNX2Q8N448 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNX2Q8N448 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNX2Q8N448 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNX2Q8N448 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNX2Q8N448 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LNX2Q8N448 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LNX2Q8N448 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LNX2Q8N448 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms