Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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