RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394015.3

KRTAP2-4-201, Transcript of keratin associated protein 2-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene KRTAP2-4, Length 764 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4-201ENST00000394015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.8■■■■□ 3.16
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
KRTAP2-4-201ENST00000394015 NACADO15069 1562 aa28.87■■■□□ 2.21
KRTAP2-4-201ENST00000394015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.84■■■□□ 2.21
KRTAP2-4-201ENST00000394015 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.83■■■□□ 2.21
KRTAP2-4-201ENST00000394015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.82■■■□□ 2.2
KRTAP2-4-201ENST00000394015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.82■■■□□ 2.2
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.56■■■□□ 2.16
KRTAP2-4-201ENST00000394015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.15■■■□□ 2.1
KRTAP2-4-201ENST00000394015 SCRIBQ14160 1630 aa28.12■■■□□ 2.09
KRTAP2-4-201ENST00000394015 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.96■■■□□ 2.07
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.71■■■□□ 2.03
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.09■■□□□ 1.93
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.98■■□□□ 1.91
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.7■■□□□ 1.87
KRTAP2-4-201ENST00000394015 SMARCA2P51531 1590 aa26.68■■□□□ 1.86
KRTAP2-4-201ENST00000394015 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.68■■□□□ 1.86
KRTAP2-4-201ENST00000394015 NCAPD3P42695 1498 aa26.64■■□□□ 1.86
KRTAP2-4-201ENST00000394015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
KRTAP2-4-201ENST00000394015 HMGXB3Q12766 1538 aa26.55■■□□□ 1.84
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
KRTAP2-4-201ENST00000394015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.97■■□□□ 1.75
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.88■■□□□ 1.73
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.86■■□□□ 1.73
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CFTRP13569 1480 aa25.79■■□□□ 1.72
KRTAP2-4-201ENST00000394015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.68■■□□□ 1.7
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ERCC6Q03468 1493 aa25.66■■□□□ 1.7
KRTAP2-4-201ENST00000394015 PRDM2Q13029 1718 aa25.61■■□□□ 1.69
KRTAP2-4-201ENST00000394015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.59■■□□□ 1.69
KRTAP2-4-201ENST00000394015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.58■■□□□ 1.69
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.52■■□□□ 1.68
KRTAP2-4-201ENST00000394015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
KRTAP2-4-201ENST00000394015 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.42■■□□□ 1.66
KRTAP2-4-201ENST00000394015 WDR62O43379 1518 aa25.34■■□□□ 1.65
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 ABCC8Q09428 1581 aa25.21■■□□□ 1.63
KRTAP2-4-201ENST00000394015 TOPBP1Q92547 1522 aa25.21■■□□□ 1.63
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.01■■□□□ 1.59
KRTAP2-4-201ENST00000394015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.01■■□□□ 1.59
KRTAP2-4-201ENST00000394015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.01■■□□□ 1.59
KRTAP2-4-201ENST00000394015 IFT140Q96RY7 1462 aa24.96■■□□□ 1.59
KRTAP2-4-201ENST00000394015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
KRTAP2-4-201ENST00000394015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.89■■□□□ 1.58
KRTAP2-4-201ENST00000394015 SOGA1O94964 1423 aa24.89■■□□□ 1.58
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
KRTAP2-4-201ENST00000394015 WDR97A6NE52 1622 aa24.8■■□□□ 1.56
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.78■■□□□ 1.56
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KRTAP2-4-201ENST00000394015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
KRTAP2-4-201ENST00000394015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
KRTAP2-4-201ENST00000394015 TRIM41Q8WV44 630 aa24.68■■□□□ 1.54
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.68■■□□□ 1.54
KRTAP2-4-201ENST00000394015 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.63■■□□□ 1.53
KRTAP2-4-201ENST00000394015 GRIN2BQ13224 1484 aa24.58■■□□□ 1.53
KRTAP2-4-201ENST00000394015 PBRM1Q86U86 1689 aa24.56■■□□□ 1.52
KRTAP2-4-201ENST00000394015 KIF27Q86VH2 1401 aa24.53■■□□□ 1.52
KRTAP2-4-201ENST00000394015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.51■■□□□ 1.51
KRTAP2-4-201ENST00000394015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.49■■□□□ 1.51
KRTAP2-4-201ENST00000394015 ADAMTS12P58397 1594 aa24.42■■□□□ 1.5
KRTAP2-4-201ENST00000394015 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.41■■□□□ 1.5
KRTAP2-4-201ENST00000394015 SYNJ2O15056 1496 aa24.39■■□□□ 1.5
KRTAP2-4-201ENST00000394015 IGF1RP08069 1367 aa24.39■■□□□ 1.49
KRTAP2-4-201ENST00000394015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CHD1O14646 1710 aa24.35■■□□□ 1.49
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CUL7Q14999 1698 aa24.34■■□□□ 1.49
KRTAP2-4-201ENST00000394015 FBLN2P98095 1184 aa24.31■■□□□ 1.48
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
KRTAP2-4-201ENST00000394015 EEA1Q15075 1411 aa24.29■■□□□ 1.48
KRTAP2-4-201ENST00000394015 GRIN2AQ12879 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
KRTAP2-4-201ENST00000394015 OSCARQ8IYS5 282 aa24.24■■□□□ 1.47
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.24■■□□□ 1.47
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.17■■□□□ 1.46
KRTAP2-4-201ENST00000394015 PRXQ9BXM0 1461 aa24.17■■□□□ 1.46
KRTAP2-4-201ENST00000394015 NUP160Q12769 1436 aa24.17■■□□□ 1.46
KRTAP2-4-201ENST00000394015 CEP170Q5SW79 1584 aa24.16■■□□□ 1.46
KRTAP2-4-201ENST00000394015 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.15■■□□□ 1.46
KRTAP2-4-201ENST00000394015 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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