Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CKAP5Q14008 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CKAP5Q14008 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CKAP5Q14008 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CKAP5Q14008 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CKAP5Q14008 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CKAP5Q14008 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CKAP5Q14008 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CKAP5Q14008 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CKAP5Q14008 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CKAP5Q14008 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CKAP5Q14008 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CKAP5Q14008 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CKAP5Q14008 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CKAP5Q14008 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CKAP5Q14008 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CKAP5Q14008 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CKAP5Q14008 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CKAP5Q14008 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CKAP5Q14008 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CKAP5Q14008 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CKAP5Q14008 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CKAP5Q14008 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CKAP5Q14008 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CKAP5Q14008 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CKAP5Q14008 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CKAP5Q14008 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CKAP5Q14008 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CKAP5Q14008 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CKAP5Q14008 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CKAP5Q14008 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CKAP5Q14008 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CKAP5Q14008 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CKAP5Q14008 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CKAP5Q14008 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CKAP5Q14008 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CKAP5Q14008 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CKAP5Q14008 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CKAP5Q14008 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CKAP5Q14008 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CKAP5Q14008 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CKAP5Q14008 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CKAP5Q14008 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CKAP5Q14008 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CKAP5Q14008 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CKAP5Q14008 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CKAP5Q14008 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CKAP5Q14008 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CKAP5Q14008 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CKAP5Q14008 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CKAP5Q14008 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CKAP5Q14008 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CKAP5Q14008 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CKAP5Q14008 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CKAP5Q14008 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CKAP5Q14008 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CKAP5Q14008 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CKAP5Q14008 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CKAP5Q14008 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CKAP5Q14008 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CKAP5Q14008 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CKAP5Q14008 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CKAP5Q14008 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CKAP5Q14008 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP5Q14008 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP5Q14008 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKAP5Q14008 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CKAP5Q14008 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP5Q14008 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP5Q14008 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CKAP5Q14008 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP5Q14008 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKAP5Q14008 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CKAP5Q14008 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKAP5Q14008 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CKAP5Q14008 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CKAP5Q14008 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CKAP5Q14008 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CKAP5Q14008 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CKAP5Q14008 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CKAP5Q14008 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CKAP5Q14008 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CKAP5Q14008 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CKAP5Q14008 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CKAP5Q14008 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CKAP5Q14008 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CKAP5Q14008 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CKAP5Q14008 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CKAP5Q14008 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CKAP5Q14008 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKAP5Q14008 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CKAP5Q14008 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CKAP5Q14008 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CKAP5Q14008 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
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