Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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