Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms