Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGA2Q9UJY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGA2Q9UJY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA2Q9UJY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms