Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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