Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6AWC8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6AWC8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6AWC8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6AWC8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6AWC8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6AWC8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q6AWC8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6AWC8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6AWC8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms