Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.123e-12■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.583e-12■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 515.56■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 316.01■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 516.01■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 PNCK-216ENST00000458354 498 ntTSL 329.02■■■□□ 2.249e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-227ENST00000475172 877 ntTSL 524.35■■□□□ 1.499e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.149e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-225ENST00000473680 1232 ntTSL 222.08■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-208ENST00000422811 771 ntTSL 320.04■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 219.36■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-220ENST00000465303 868 ntTSL 419.25■□□□□ 0.679e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-219ENST00000463548 783 ntTSL 518.58■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-207ENST00000419804 561 ntTSL 418.58■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-209ENST00000423545 448 ntTSL 418.21■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-223ENST00000466662 464 ntTSL 317.86■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 317.71■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-206ENST00000418241 566 ntTSL 317.38■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-212ENST00000434652 311 ntTSL 517.38■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 217.28■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-224ENST00000472324 2143 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-222ENST00000466638 1204 ntTSL 216.28■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 516.09■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-214ENST00000439087 754 ntTSL 514.83□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-232ENST00000489536 836 ntTSL 214.78□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-211ENST00000433470 717 ntTSL 514.16□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PNCK-205ENST00000411968 557 ntTSL 59.38□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 27.47□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ST6GAL1-218ENST00000464827 494 ntTSL 29.25□□□□□ -0.938e-10■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 34.98□□□□□ -1.616e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 RWDD3-205ENST00000492639 549 ntTSL 316.85■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 RWDD3-206ENST00000495272 1294 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 RWDD3-204ENST00000473397 513 ntTSL 312.4□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 RWDD3-207ENST00000497058 796 ntTSL 211.69□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 32.3
TARDBPQ13148 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 422.63■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-206ENST00000455383 578 ntTSL 519.32■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 317.94■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-203ENST00000420813 491 ntTSL 417.68■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 EP300-203ENST00000634690 559 ntTSL 56.01□□□□□ -1.453e-8■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-21■■■■■ 32.2
TARDBPQ13148 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.434e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.424e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.564e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 EPG5-208ENST00000590854 6375 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.914e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 GLCCI1-209ENST00000489405 1475 ntTSL 57.74□□□□□ -1.174e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.344e-10■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.17e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-214ENST00000532737 680 ntTSL 424.19■■□□□ 1.461e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.831e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-210ENST00000489108 443 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 USP48-212ENST00000527823 554 ntTSL 48.49□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 32.1
TARDBPQ13148 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 32
TARDBPQ13148 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.233e-16■■■■■ 32
TARDBPQ13148 LINC01088-204ENST00000507761 842 ntTSL 24.92□□□□□ -1.623e-16■■■■■ 32
TARDBPQ13148 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 ATG7-212ENST00000446110 435 ntTSL 35.52□□□□□ -1.531e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 ATG7-208ENST00000427759 455 ntTSL 34.49□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 32
TARDBPQ13148 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 32
TARDBPQ13148 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 32
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 143 ms