Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEFA6Q01524 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA6Q01524 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms