Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX5P48382 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX5P48382 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX5P48382 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX5P48382 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX5P48382 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RFX5P48382 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX5P48382 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX5P48382 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX5P48382 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX5P48382 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX5P48382 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX5P48382 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX5P48382 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX5P48382 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX5P48382 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX5P48382 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX5P48382 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX5P48382 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX5P48382 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX5P48382 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX5P48382 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX5P48382 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX5P48382 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX5P48382 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX5P48382 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX5P48382 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFX5P48382 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RFX5P48382 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX5P48382 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX5P48382 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX5P48382 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX5P48382 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX5P48382 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX5P48382 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX5P48382 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RFX5P48382 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFX5P48382 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFX5P48382 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms