Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR1EP28566 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR1EP28566 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms