Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCKDKO14874 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCKDKO14874 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms