Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD12O00232 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD12O00232 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms