Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ18B7U540 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms