Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms