Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PSMB5P28074 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PSMB5P28074 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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