Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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