Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms