Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM8Q9BZR9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM8Q9BZR9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM8Q9BZR9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM8Q9BZR9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM8Q9BZR9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM8Q9BZR9 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM8Q9BZR9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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