Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms