Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms