Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms