Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CKAP5Q14008 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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