Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms