Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms