Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRIM48Q8IWZ4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRIM48Q8IWZ4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRIM48Q8IWZ4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM48Q8IWZ4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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